Hay varias herramientas para crear GIF animados de un modo rápido y sencillo desde una consola. Probablemente la más simple y rápida sea Imagemagick, la herramienta estrella y más versátil para manipulación de imágenes desde un terminal.
Por ejemplo para hacer el GIF con el que el otro día os comentaba el origen del nombre de la boca de Dragón habría bastado con copias las imágenes a una carpeta y escribir en un terminal:convert secuenciaFotos*jpg -delay 10 resultado.gif
El problema es que como la secuencia de fotografías la tomé sujetando la cámara con una mano (sin trípode) y la otra sujetando la flor, el movimiento, si bien no es muy perceptible en fotogramas fijos producía un tembleque muy antipático en el gif animado, así es que manipulé algo las imágenes antes de generar el gif buscando estabilizar algo es movimiento.