Combinando un par de comandos (posiblemente tengas que instalar ksystraycmd ) podemos fácilmente construir una acceso rápido que nos envíe la ventana de cualquier aplicación a la bandeja del sistema con un simple clic.

Abre el menú para crear accesos rápidos ( kcmshell4 khotkeys ) y crea Nuevo acceso rápido global > Orden/URL. Asigna una combinación de teclas a tu gusto y en la solapa de Acción escribe:
ksystraycmd --hidden --wid $(xwininfo | grep " Window id:" | awk '{print $4}')
Una vez creada la nueva combinación ejecútala, verás que el cursor cambia a un puntero en forma de cruz, cliquea sobre cualquier ventana deseada y esta será minimizada a la bandeja del sistema desde donde puedes ocultarla, desocultarla, desempotrarla (restaurar situación anterior) y salir.
Es muy cómodo para mantener en ejecución consolas con lecturas de log, escaneando, conexiones de vídeo, y en general cualquier aplicación que queramos consultar a intervalos